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BIOINFORMATICA

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BIOINFORMATICS

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Anno accademico 2014/2015

Codice dell'attività didattica
MFN1194
Docente
Prof. Marco Botta (Titolare)
Corso di studi
[f008-c501] LM in Biologia Cellulare e Molecolare (Classe LM-06)
Anno
1° anno
Periodo didattico
I semestre
Tipologia
Affine o integrativo
Crediti/Valenza
6
SSD dell'attività didattica
INF/01 - informatica
Modalità di erogazione
Tradizionale
Lingua di insegnamento
Italiano
Modalità di frequenza
Lezioni facoltative e esercitazioni obbligatorie
Tipologia d'esame
Orale
Prerequisiti

Formalmente nessuno. Nozioni di algoritmi, intelligenza artificiale e biologia di base possono essere utili.
Formally none. Knowledge of algorithms, artificial intelligence and basic biology would help.

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Sommario del corso

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Obiettivi formativi

Il corso fornisce, da un lato, i fondamenti della problematiche biologiche e, dall'altro, delle tecniche algoritmiche per affrontare questi problemi.
The course provides, on one side, a general overview of biological problems, and, on the other side, describes the main techniques used to deal with these problems.

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Risultati dell'apprendimento attesi

Al termine del corso lo studente sarà in grado di colloquiare con il biologo, comprendere il problema biologico e suggerire una soluzione informatizzata basata sulle tecniche apprese nel corso.
The student will be able to discuss with the biologist, to understand the biological problem at hand, and to suggest a solution based on the techniques learned during the course.

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Modalità di verifica dell'apprendimento

scritta e orale
written and oral

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Programma

Introduzione alla biologia molecolare. Algoritmi di allineamento di sequenze. Algoritmi di allineamento multiplo. Costruzione di alberi filogenetici. Struttura delle proteine e predizione della struttura. Reti di regolazione genica: modelli e algoritmi di inferenza. Organizzazione e interrogazione di database biologici.
Introduction to molecular biology. Sequence alignment algorithms. Multiple sequence alignment algorithnms. Phylogenetic tree construction algorithms. Protein structure prediction algorithms. Gene networks: models and inference algorithms. Organization and query of biological databases.

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Testi consigliati e bibliografia

A.M. Lesk, "Introduzione alla Bioinformatica", McGraw-Hill Ed. G. Valle, M. Helmer Citterich, M. Attimonelli, G. Pesole "Introduzione alla Bioinformatica", Zanichelli Ed. D.E. Krane e M.L. Raymer, "Fondamenti di Bioinformatica", Pearson Education Italia Ed.
A.M. Lesk, "Introduzione alla Bioinformatica", McGraw-Hill Ed. G. Valle, M. Helmer Citterich, M. Attimonelli, G. Pesole "Introduzione alla Bioinformatica", Zanichelli Ed. D.E. Krane e M.L. Raymer, "Fondamenti di Bioinformatica", Pearson Education Italia Ed.

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Ultimo aggiornamento: 13/05/2015 09:40
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