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Bioinformatica (coorte 2011/2012)

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Anno accademico 2010/2011

Codice dell'attività didattica
MFN1194
Docenti
Prof. Marco Botta
Dott. Massimiliano De Pierro
Corso di studi
[f008-c501] LM in Biologia Cellulare e Molecolare (Classe LM-06)
Anno
1° anno
Periodo didattico
I semestre
Tipologia
Affine o integrativo
Crediti/Valenza
6
SSD dell'attività didattica
INF/01 - informatica
Oggetto:

Sommario insegnamento

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Programma



Introduzione alla Bioinformatica - Introduzione ai principi delle basi di dati - Algoritmi di Clustering e Filogenesi - Algoritmi di Allineamento - Introduzione ai Grafi - Algoritmi di predizione della struttura delle proteine - Algoritmi di classificazione - Estrazione di profili e Hidden Markov Models



Introduction to Bioinformatics - Introduction to database principles - Clustering algorithms and phylogenesis - Alignment Algoritms - Introduction to Graph Theory - Protein Structure prediction algorithms - Classification Algorithms - Profile extraction and Hidden Markov Models



Il corso si propone di fornire le metodologie di base per l'estrazione e analisi di conoscenza dai dati di natura biologica (es. sequenze molecolari, strutture molecolari, microarray di DNA, pathway metabolici) allo scopo di approfondire la comprensione dei processi biologici coinvolti. In particolare lo studente sara` introdotto all'utilizzo delle principali banche dati di biologia molecolare e alle principali tecniche di calcolo e statistiche sviluppate per inferire sui processi biologici. Le basi teoriche sottostanti le metodologie introdotte verranno ampiamente discusse.



Il materiale didattico presentato a lezione è disponibile sul sito internet.  

Krane Dan E., Raymer Michael L., Fondamenti di bioinformatica. Pearson Education



Esame scritto.



Non è richiesta nessuna propedeuticità.

La frequenza alle lezioni non è obbligatoria; per i corsi di laboratorio e le attività di esercitazione relative ai corsi la frequenza è obbligatoria e non può essere inferiore al 70% delle ore previste.

Testi consigliati e bibliografia



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Ultimo aggiornamento: 13/01/2012 15:25
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