Oggetto:
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Environmental Microbiology

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Environmental Microbiology

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Anno accademico 2025/2026

Codice attività didattica
SVB0319
Docente
Irene Stefanini
Corso di studio
[2202M21] laurea magistrale in Biologia dell'Ambiente
Anno
1° anno, 2° anno
Periodo
I semestre
Tipologia
A scelta dello studente
Crediti/Valenza
4
SSD attività didattica
BIOS-15/A - Microbiologia
Erogazione
Tradizionale
Lingua
English
Frequenza
Lezioni facoltative e esercitazioni obbligatorie
Tipologia esame
Scritto ed orale
Prerequisiti

Conoscenza di base di Microbiologia Generale e Applicata


Basic knowledge of general and applied microbiology
Propedeutico a
Oggetto:

Sommario insegnamento

Oggetto:

Avvisi

Informazioni per studenti con DSA o Disabilità: servizi di Ateneo e supporto per sostenere gli esami
Oggetto:

Obiettivi formativi

L'insegnamento contribuisce agli obiettivi del CdS fornendo competenze per analizzare e monitorare le comunità microbiche ambientali, valutare i rischi associati e progettare interventi di biorisanamento, con applicazioni nella ricerca, nella gestione ambientale e nella consulenza.

Gli obiettivi formativi principali dell’insegnamento riguardano le conoscenze:

- dell’evoluzione e dei meccanismi di adattamento dei microrganismi cellulari e virali in ambienti naturali;
- del ruolo dei microrganismi in natura;
- dei meccanismi delle interazioni tra microrganismi e altri microrganismi o organismi superiori in ambienti naturali (microbiomi e microbiota);
- delle tecniche per il monitoraggio e contenimento dei microrganismi in ambienti naturali;
- dei principi dell’utilizzo delle capacità metaboliche dei microrganismi in applicazioni ambientali.

 

The teaching contributes to the objectives of the Degree Course by providing skills to analyze and monitor environmental microbial communities, evaluate associated risks and design bioremediation interventions, with applications in research, environmental management and consultancy.

The main educational objectives of the course concern the knowledge:
- the evolution and adaptation mechanisms of cellular and viral microorganisms in natural environments;
- the role of microorganisms in nature;
- the mechanisms of interactions between microorganisms and other microorganisms or higher organisms in natural environments (microbiomes and microbiota);
- techniques for monitoring and containing microorganisms in natural environments;
- the principles of using the metabolic capacities of microorganisms in environmental applications.

 

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Risultati dell'apprendimento attesi

Al termine dell'insegnamento, è richiesta l'acquisizione delle seguenti capacità:

CONOSCENZA:
- Descrivere l’evoluzione e i meccanismi di adattamento dei microrganismi e riconoscere il loro ruolo nei cicli biogeochimici con esempi reali.

CAPACITÀ di APPRENDERE:
- Consultare letteratura scientifica internazionale per aggiornare competenze su microbiomi e applicazioni ambientali.

CAPACITÀ APPLICATIVE:
- Utilizzare metodi di monitoraggio (metabarcoding, coltura, biotecnologie) su casi studio e interpretare dataset microbiologici.

AUTONOMIA DI GIUDIZIO:
- Valutare articoli e dati sperimentali per proporre strategie di contenimento/sfruttamento dei microrganismi in ambito ambientale.

ABILITÀ NELLA COMUNICAZIONE:
- Presentare un elaborato individuale o di gruppo su un articolo scientifico, con grafici e lessico tecnico.

Upon completion of the course, students are expected to have acquired the following skills:

KNOWLEDGE:
- Describe the evolution and adaptation mechanisms of microorganisms and recognize their role in biogeochemical cycles with real-world examples.

LEARNING SKILLS:
- Consult international scientific literature to update skills on microbiomes and environmental applications.

APPLICATION SKILLS:
- Use monitoring methods (metabarcoding, culture, biotechnology) on case studies and interpret microbiological datasets.

JUDGMENT SKILLS:
- Evaluate articles and experimental data to propose strategies for the containment/exploitation of microorganisms in the environmental context.

COMMUNICATION SKILLS:
- Present an individual or group paper on a scientific article, using graphs and technical vocabulary.

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Programma

1. Ruolo dei microrganismi (batteri, funghi, virus) negli ecosistemi e nei cicli biogeochimici.

2. Interazioni microbiche e microbiomi ambientali.

3. Metodi di analisi delle comunità microbiche.

4. Applicazioni ambientali: biorisanamento, trattamento dei reflui, compostaggio.

5. Discussione articoli e casi studio.

 

1. Role of microorganisms (bacteria, fungi, viruses) in ecosystems and biogeochemical cycles.

2. Microbial interactions and environmental microbiomes.

3. Methods for analyzing microbial communities.

4. Environmental applications: bioremediation, wastewater treatment, composting.

5. Discussion of articles and case studies.

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Modalità di insegnamento

Questo insegnamento prevede lezioni frontali e seminari che prevedono una forte componente interattiva con il docente, cui si aggiunge la presentazione di una revisione scientifica, per un totale di 36 ore di didattica. 

DE (Didattica Erogativa): 20 h lezioni frontali; DI (Didattica Interattiva): 16 h seminari interattivi e presentazioni di articoli scientifici.

Attività progettate in allineamento costruttivo con i Risultati dell'Apprendimento Attesi (lezioni → conoscenza; seminari → applicare/giudizio; presentazioni → comunicazione). 

Tutte le lezioni si terranno in presenza.

 

This course includes lectures and seminars with a strong interactive component, complemented by the presentation of a scientific review, for a total of 36 hours of teaching.

DE (Delivery Teaching): 20 hours of lectures; DI (Interactive Teaching): 16 hours of interactive seminars and presentations of scientific articles.

Activities designed to be constructively aligned with the Expected Learning Outcomes (lectures → knowledge; seminars → application/judgment; presentations → communication).

All lessons will be held in person.

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Modalità di verifica dell'apprendimento

L’apprendimento viene verificato attraverso una prova scritta e un colloquio orale.

PROVA SCRITTA - La prova scritta è costituita da 10 domande a risposta aperta, con commento di schemi e immagini. Le domande intendono valutare le conoscenze acquisite sugli argomenti trattati e la capacità di argomentare risposte con proprietà di specifico linguaggio disciplinare. Il tempo a disposizione è di 60 minuti.

COLLOQUIO ORALE -Il colloquio orale consiste in una presentazione sull’approfondimento di un argomento individualmente scelto e concordato con il docente. La presentazione e il successivo colloquio intendono valutare la capacità comprensione e valutazione critica della letteratura e il livello di approfondimento degli argomenti del programma.

Il voto finale tiene conto della valutazione della prova scritta e del colloquio orale.

  • Scritto (60%) – 60 min: correttezza concetti (40%), capacità di sintesi (30%), uso linguaggio tecnico (30%).
  • Orale (40%) – 20 min: valutazione critica dell’articolo (50%), chiarezza espositiva (30%), uso di fonti e grafici (20%).
  • Scala: 0–30; soglia 18; modalità vincolanti per tutte le sessioni.

 

Learning is verified through a written test and an oral interview.

WRITTEN TEST - The written test consists of 10 open-ended questions, with comments on diagrams and images. The questions intended to evaluate the knowledge acquired on the topics covered and the ability to argue answers with properties of specific disciplinary language. The time available is 60 minutes.

ORAL INTERVIEW - The interview consists of a presentation by the student on the deepening of a topic chosen by the student and agreed with the teacher. The presentation and the subsequent interview intend to evaluate the ability to understand and critically evaluate literature and the level of depth of the topics of the program.

The final grade takes into account the evaluation of the written exam and the oral exam.

  • Written (60%) – 60 min: correct concepts (40%), ability to summarize (30%), use of technical language (30%).
  • Oral (40%) – 20 min: critical evaluation of the article (50%), clarity of exposition (30%), use of sources and graphs (20%).
  • Scale: 0–30; threshold 18; binding for all sessions.
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Attività di supporto

Materiali su Moodle; ricevimento studenti su appuntamento (presenza/online); tutorato per supporto alle esercitazioni e alla preparazione di articoli scientifici.

Materials available on Moodle; student office hours by appointment (in person/online); tutoring for exercises and the preparation of scientific papers.

Testi consigliati e bibliografia



Oggetto:
Libro
Titolo:  
Microbiologia ambientale ed elementi di ecologia microbica
Anno pubblicazione:  
2013
Editore:  
Casa Editrice Ambrosiana
Autore:  
Paola Barbieri, Giuseppina Bestetti, Enrica Galli, Davide Zannoni
Obbligatorio:  
No
Oggetto:

  • Obbligatoria: Slide Moodle.
  • Consigliata:
    ▪ Barbieri P. et al. (2013). Microbiologia ambientale ed elementi di ecologia microbica. Ambrosiana, Milano. ISBN 978-8-80-818434-4
    ▪ Pepper I.L., Gerba C.P., Gentry T.J. (2015). Environmental Microbiology. Academic Press. ISBN 978-0-12-394626-3
    ▪ Madigan M.T. et al. (2020). Brock Biology of Microorganisms. Pearson. ISBN 9780135860717

Le presentazioni delle lezioni da sole non costituiscono materiale didattico sufficiente per la preparazione della verifica dell'apprendimento. L'integrazione delle presentazioni con i libri consigliati sarà di supporto e guida alla preparazione delle verifiche di esame.

  • Required: Moodle Slides.
  • Recommended:
    ▪ Barbieri P. et al. (2013). Environmental Microbiology and Elements of Microbial Ecology. Ambrosiana, Milan. ISBN 978-8-80-818434-4
    ▪ Pepper I.L., Gerba C.P., Gentry T.J. (2015). Environmental Microbiology. Academic Press. ISBN 978-0-12-394626-3
    ▪ Madigan M.T. et al. (2020). Brock Biology of Microorganisms. Pearson. ISBN 9780135860717

Lecture presentations alone are not sufficient teaching material for preparing for the exam. Integrating the presentations with the recommended books will support and guide students in preparing for the exams.



Oggetto:

Note

Per chi ha DSA o disabilità che possono condizionare l'apprendimento (ad esempio daltonismo, ipovisione, ipouditoi, dislessia o disabilità fisica), si invita a prendere contatto con i docenti in modo da adeguare il materiale didattico e le loro modalità di verifica. Studenti/esse con DSA o disabilità, sono pregati di prendere visione delle modalità di supporto (https://www.unito.it/servizi/lo-studio/studenti-con-disabilita) e di accoglienza (https://www.unito.it/accoglienza-studenti-con-disabilita-e-dsa) di Ateneo, ed in particolare delle procedure necessarie per il supporto in sede d’esame (https://www.unito.it/servizi/lo-studio/studenti-con-disabilita/supporto-agli-studenti-con-disabilita-sostenere-gli-esami).  

Students with learning disabilities (LDs) or disabilities that may impact learning (e.g., color blindness, low vision, hearing impairment, dyslexia, or a physical disability) are encouraged to contact their instructors so they can adjust their teaching materials and assessment methods. Students with learning disabilities (LDs) or disabilities are asked to review the University's support (https://www.unito.it/servizi/lo-studio/studenti-con-disabilita) and reception (https://www.unito.it/accoglienza-studenti-con-disabilita-e-dsa) procedures, particularly the procedures for exam support (https://www.unito.it/servizi/lo-studio/studenti-con-disabilita/supporto-agli-studenti-con-disabilita-sostenere-gli-esami).

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Orario lezioniV

Registrazione
  • Aperta
    Oggetto:
    Ultimo aggiornamento: 03/11/2025 13:40
    Location: https://lmbiologia.campusnet.unito.it/robots.html
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