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Chimica Biologica Metabolica

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Anno accademico 2008/2009

Codice dell'attività didattica
MFN0324
Docente
Prof. Sandro Paolo Solinas
Corso di studi
[f008-c501] Biologia cellulare e molecolare
[f008-c508] Biologia dell'Ambiente
Anno
1° anno
Periodo didattico
I semestre
Tipologia
Caratterizzante
Crediti/Valenza
6
SSD dell'attività didattica
BIO/10 - biochimica
Oggetto:

Sommario insegnamento

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Programma

Principi di bioenergetica: Studio del metabolismo. l’ATP, la variazione di energia libera, il potenziale di energia di trasferimento, il NAD+, il FAD, il CoA.

Le funzioni mitocondriali. La catena di trasporto degli elettroni e la fosforilazione ossidativa. Inibitori e disaccoppianti; la termogenina.
Meccanismi di regolazione metabolica: disponibilità del substrato, modificazioni covalenti, controllo allosterico, controllo a feed-back, controllo ormonale, ciclo futile. La carica energetica. Il rendimento energetico del metabolismo.

Esercitazioni teoriche: principi di chimica delle soluzion, procedimenti utili per calcoli che riguardano la concentrazione delle soluzioni, percentuale in peso, percentuale in volume, percentuale peso-volume, concentrazione molare, concentrazione molale, concentrazione normale, frazione molare, parti per milione. 
Meccanismi di regolazione a cascata mono- e bi-ciclica. Meccanismi di trasduzione del segnale in epatociti, fibre α- e β- adrenergiche; il fosfatidilinositolo.

Biochimica ormonale: insulina, glucagone, catecolamine, ormoni della tiroide, ormoni ipofisar, ormoni ipotalamici, la melatonina, ormoni del surrene, ormoni sessuali, ormoni prodotti da tessuti non specifici.

Esercitazioni teoriche: problemi relativi soluzioni e diluizioni. Misura colorimetrica del pH, teoria degli indicatori, curve di titolazione.

Metabolismo dei carboidrati: glicolisi aerobia e anaerobia; fermentazione lattica e alcolica; shuttle del DHAP-glicerofosfato e del malato-aspartato. Rendimento energetico della glicolisi. La glicolisi in diversi tessuti: cervello, muscolo, adipocita, epatocita ed eritrocita. Regolazione della glicolisi epatica e muscolare. La carica energetica. Inibitori della glicolisi. Metabolismo del fruttosio e del galattosio. Rendimento energetico. Via dei pentosi fosfati.

Metabolismo del glicogeno: struttura e funzione metabolica. Ciclo di Cori, ciclo dell’alanina. La gluconeogenesi.

Il ciclo degli acidi tricarbossilici. Regolazione del ciclo degli acidi tricarbossilici; vie anaplerotiche. Rendimento energetico.

Metabolismo dei lipidi. Meccanismi di controllo nel metabolismo lipidico. Demolizione dei trigliceridi nel tessuto adiposo e destino degli ac. grassi nel muscolo e nel fegato. β- ossidazione degli ac. grassi, rendimento energetico; chetogenesi. Trasporto del citrato. Biosintesi degli ac. grassi. Biosintesi dei fosfolipidi di membrana. Biosintesi del colesterolo.

Esercitazioni teoriche: messa a punto di metodi analitici per la determinazione del glucosio, del fruttosio, del colesterolo, transaminasi, fosfatasi, gamma-GT, amilasi, calcio, ammoniaca, creatinchinasi, etanolo, acetone, acido urico.

Biosintesi e degradazione dei nucleotidi. Meccanismi di regolazione e sintesi di nucleotidi purinici e pirimidinici attraverso le vie ex-novo, di interconversione e di recupero. Cause di sovraproduzione di acido urico.

Relazioni metaboliche tra organi. Ciclo digiuno-alimentazione: Metabolismi tessuto specifici.

Degradazione degli aminoacidi e ciclo dell’urea. Reazioni di deaminazione, transdeaminazione; glutamico deidrogenasi, glutamina sintasi. Meccanismo di controllo a  “feedback sequenziale”. Aminoacidi glucogenetici e chetogenetici. Ureogenesi: regolazione e connessioni con il metabolismo dei carboidrati.

Processi di detossificazione cellulare. Glutatione. Principali funzioni; GSH perox; GSH reduttasi; tiolotranferasi; GSH solfotransferasi. Ciclo del γ- glutamile. Leucotrieni: Biotrasformazione e processi di detossificazione: GSH perox / GSSG reduttasi; composti di coniugazione e biosintesi degli acidi mercapturici.

Radicali liberi. Chimica dei radicali liberi; azione tossica dei radicali liberi sui sistemi biologici; ossigeno tripletto e ossigeno singoletto; specie radicaliche dell’O2. Fonti biologiche dei radicali liberi dell’O2. Produzione dei radicali liberi a livello mitocondriale: semiriduzione dell’ossigeno; formazione dell’anione superossido e del radicale idroperossile; formazione del radicale idrossile: reazione di Haber-Weiss e reazione di Fenton. Produzione dei radicali liberi a livello microsomiale, ruolo del cit P450. Sistemi di difesa contro il danno ossidativo.Radiolisi dell’acqua e azione scavenger del GSH. Danni causati dal radicale idrossile sui lipidi di membrana; perossidazione degli acidi grassi polinsaturi, ruolo della vit.E, del colesterolo e della vit.C; danni sugli acidi nucleici.

Generation and storage of metabolic energy. Metabolism, basic concepts and design. Strategy of metabolism. Carbohydrates. The metabolic pathways and control sites in the following metabolisms: glycolysis, citric acid cycle, oxidative phosphorylation, pentose phosphate pathway, gluconeogenesis, glycogen metabolism, fatty acid metabolism, amino acid degradation, urea cycle, biosynthesis of membrane lipids, biosynthesis of cholesterol, biosynthesis of nucleotides. Hormonal regulators of fuel metyabolism. Oxidative stress and ROS production, chemical and biological effects. Antioxidant and defense systems.
Exercises will focus on the calculations of solution concentration and on the design of enzymatic methods usefull to determine some biochemical analytes.

Il corso si propone di fornire allo studente una visione particolareggiata dei meccanismi di regolazione del metabolismo, attraverso l’acquisizione dei principi che governano la generazione e conservazione dell’energia metabolica, il metabolismo di composti di interesse biologico, le principali alterazioni metaboliche connesse, aspetti generali dello stress ossidativo, la produzione e l’azione tossica dei radicali liberi dell’ossigeno. Alle lezioni frontali si affiancano alcune esercitazioni teoriche volte a coinvolgere lo studente in applicazioni pratiche di determinazione di analiti di importante interesse metabolico.



BIOCHIMICA – C.K. Mathews, K.E. van Holde, 2° ed. Casa Editrice Ambrosiana, 1998 – Milano.
PRINCIPI DI BIOCHIMICA - Albert L. Lehninger, 2° ed., Zanichelli Editore, 1997- Bologna.
PRINCIPI DI BIOCHIMICA ORMONALE - Gian Paolo Rossini, Zanichelli Editore, 1992 -Bologna.
METODOLOGIE DI BASE PER LE SCIENZE BIOMOLECOLARI – R. Reed, D. Holmes, J. Weyers, A. Jones, Zanichelli Editore, 2002, Bologna

E’ fortemente consigliato l’utilizzo del seguente materiale per approfondimenti e integrazioni:

1.    Martinez-Cayuela M.  Oxygen free radicals and human disease. Biochimie. 1995;77(3):147-61. Review.
2.    Storz G, Imlay JA.  Oxidative stress. Curr Opin Microbiol. 1999 Apr;2(2):188-94. Review.
3.    Costa V, Moradas-Ferreira P.  Oxidative stress and signal transduction in Saccharomyces cerevisiae: insights into ageing, apoptosis and diseases. Mol Aspects Med. 2001 ; 22: 217-46. Review.

Infine sono di seguito indicati altri siti internet di interesse:

1.    Nutritional and Metabolic Diseases: http://www.mic.stacken.kth.se/Diseases/C18.html
2.    The medical biochemistry page : http://themedicalbiochemistrypage.org/
3.    Banca Dati di Composizione degli Alimenti: http://www.inran.it/servizi_cittadino/per_saperne_di_piu/tabelle_composizione_alimenti




Scritto e orale congiunti.
Descrizione di un processo metabolico.


Propedeuticità: Chimica Biologica.

La frequenza alle lezioni non è obbligatoria; per i corsi di laboratorio e le attività di esercitazione relative ai corsi la frequenza è obbligatoria e non può essere inferiore al 70% delle ore previste. 


 

Testi consigliati e bibliografia



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Note

LM BA: Curriculum Ecologia Vegetale, Curriculum Conservazione e Biodiversità Animale, Curriculum Igiene dell’ambiente e del lavoro

LM BCM: Curriculum Biomedico, Curriculum Biomolecolare, Curriculum NeurobiologicoCurriculum Biomedico, Curriculum Biomolecolare, Curriculum Neurobiologico

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Ultimo aggiornamento: 29/09/2009 15:43
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