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Metodi di Inferenza Filogenetica

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Methods of Phylogenetic Inference

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Anno accademico 2013/2014

Codice dell'attività didattica
MFN1546
Docente
Dott. Massimo Meregalli
Corso di studi
[f008-c508] LM in Biologia dell'Ambiente (Classe LM-06)
Anno
2° anno
Periodo didattico
I semestre
Tipologia
A scelta dello studente
Crediti/Valenza
4
SSD dell'attività didattica
BIO/05 - zoologia
Modalità di erogazione
Tradizionale
Lingua di insegnamento
Italiano
Modalità di frequenza
Lezioni facoltative e esercitazioni obbligatorie
Tipologia d'esame
Orale
Prerequisiti
Iscrizione a una laurea magistrale di Scienze Biologiche o Scienze Naturali. Iscritti ad altri corsi di studi devono contattare il docente prima di inserire questo corso nel proprio carico didattico
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Sommario del corso

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Obiettivi formativi

Il corso si propone di fornire agli studenti una approfondita conoscenza delle basi concettuali delle ricostruzioni filogenetiche, a partire da una disamina dei concetti di specie e delle modalità di speciazione, e delle interpretazioni in chiave evolutiva dei caratteri morfologici e molecolari. Gli studenti inoltre acquisiranno la capacità di elaborazione tramite l'utilizzo dei programmi informatici attualmente utilizzati per tutte le analisi e le ricostruzioni di filogenesi.

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Risultati dell'apprendimento attesi

Capacità di preparare matrici per elaborazione di dati per ricostruzione della filogenesi di gruppi di organismi, utilizzo dei software di analisi filogenetica

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Programma


Concetti di specie e modalità di speciazione
Basi concettuali di ricostruzione filogenetica e analisi cladistica
Metodi di elaborazione statistica (parsimonia, ML, inferenza bayesiana)
Utilizzo dei programmi di ricostruzione filogenetica




Concepts of species and mechanisms of speciation
Conceptual bases of cladistic analysis
Statistical methods of phylogenetic inference (parsimony, maximum likelihood, bayesian analysis)
Use of software of phylogenetic inference




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Testi consigliati e bibliografia

Il materiale didattico presentato a lezione è disponibile sul sito internet.

I testi base consigliati per il corso sono: Davide Sassi. Elementi di Sistematica Biologica, Aracne editore

E’ fortemente consigliato l’utilizzo del seguente materiale per approfondimenti e integrazioni: programmi di inferenza filogenetica gratuitamente disponibili online: Phylip, TNT, raxmlGUI, MrBayes

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Ultimo aggiornamento: 26/06/2014 14:14
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