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Biologia Cellulare Molecolare Avanzata

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Anno accademico 2009/2010

Codice dell'attività didattica
MFN0378
Docenti
Prof. Michele De Bortoli (Titolare, Responsabile dell'insegnamento)
Isabelle Perroteau (Titolare)
Giovanna Gambarotta (Titolare)
Corso di studi
[f008-c501] LM in Biologia Cellulare e Molecolare (Classe LM-06)
Anno
1° anno
Periodo didattico
I semestre
Tipologia
Caratterizzante
Crediti/Valenza
12 (6+6)
SSD dell'attività didattica
BIO/06 - anatomia comparata e citologia
BIO/11 - biologia molecolare
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Sommario insegnamento

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Programma



Il corso fornisce una dettagliata conoscenza dei meccanismi della regolazione dell’omeostasi e del differenziamento cellulare, visti sia dal punto di vista della comunicazione intercellulare e della trasduzione dei segnali di controllo, sia dal punto di vista della regolazione dell’attività del genoma, a livello  trascrizionale e post-trascrizionale. Il corso fornisce anche una conoscenza dei metodi di indagine utilizzati in questo campo. Un’attenzione particolare è rivolta a formare  la capacità di analizzare ed interpretare risultati dell’attuale letteratura scientifica, attraverso una serie di esercitazioni concernenti la lettura e comprensione di articoli scientifici attuali sugli argomenti svolti nelle lezioni. Per ciascun articolo si mette in evidenza la specifica domanda scientifica rispetto allo stato attuale delle conoscenze, si discute con particolare attenzione l’approccio sperimentale seguito dagli autori, si interpretano i dati sperimentali. Infine si analizza come questi risultati integrano, oppure rimettono in discussione, gli schemi generali del funzionamento cellulare e del genoma.

BIOLOGIA CELLULARE AVANZATA (BIO/06, 6 ECTS):  Trasduzione del segnale e cross-talk recettoriale, trasporti intracellulari, regolazioni del ciclo cellulare,  autofagocitosi, ubiquitinazioni,  cellule staminali e differenziamento cellulare, molecole d’adesione e trasduzione del segnale d’ancoraggio, caderine e regolazione della proliferazione cellulare, migrazione cellulare e riconoscimento cellula-cellula.

BIOLOGIA MOLECOLARE GENOMICA (BIO/11, 6 ECTS): Genomi ed attività genomica globale: microarrays e metodi di sequenziamento globale. Diverse classi di RNA codificante e noncodificante. Struttura della cromatina. Modificazioni epigenetiche, silenziamento, imprinting. Splicing alternativo, trascritti alternativi e loro regolazione. Valutazione genomica, funzionale ed evolutiva. Regolazione trascrizionale, coattivatori e corepressori, modificazioni e dinamica della cromatina. Organizzazione nucleare e interazioni cromatiche a grande distanza. Regolazione del trasporto, localizzazione e stabilità degli mRNA. Micro RNA e proteine leganti RNA.

Nota: Oltre alle lezioni ed esercitazioni, sono previste attività didattiche opzionali, di norma online sulla piattaforma Moodle, la cui valutazione potrà dare luogo a punti aggiuntivi alla prova orale nei due appelli successivi alla fine del corso.

 

 

 


Descrittori di Dublino:

  1. Conoscenze e capacità di compensione dei meccanismi di regolazione dell’omeostasi e del differenziamento cellulare, della regolazione dell’attività del genoma,  conoscenze introduttive alla biologia dei sistemi e dei loro metodi di studio.
  2. Capacità di proporre soluzioni sperimentali adeguate e moderne a problematiche di biologia cellulare e molecolare.
  3. Autonomia di giudizio in merito all'interpretazione e comparazione di dati scientifici
  4. Abilità nella comunicazione e nell'esposizione di dati scientifici ricavati da pubblicazioni tematiche di alto livello. ICT.
  5. Capacità di apprendimento in particolare nella conduzione autonoma di ricerche bibliografiche di settore e nell’interpretazione di articoli scientifici

 

 

 

 

Il materiale didattico presentato a lezione è disponibile sul sito internet del corso e sulla piattaforma Moodle di didattica online

I testi base consigliati per il corso sono:

Genomi 3
TA Brown,
Edises

La cellula:
un approccio molecolare

Cooper e Hausman,
IV edizione, 2009,
PICCIN editore

 

 



L'esame è orale e si svolge, di norma, come segue:

  1. Presentazione di articoli scientifici da parte dello studente (da svolgere una volta sola durante le esercitazioni del corso, valutazione mantenuta nel tempo).
  2. Colloquio orale sulle diverse parti del corso e sui specifici risultati scientifici, con relativa metodologia, discussi durante le lezioni e/o esercitazioni (sempre riferito all'ultimo programma svolto).

nota: vedere in calce al programma la valutazione delle attività opzionali online degli studenti frequentanti.

 

 

 

 

 



Nessuna

 

 

 

 

 

 

Program

This course aims at detailed knowledge of regulatory mechanisms of cell differentiation and homeostasis, from two complementary views. First, cell-to-cell communication and intracellular transduction of control signalling is considered. Second, the control of genomic activity and function, at both the transcriptional and post-transcriptional level, is examined. The course also provides knowledge on modern methods used in this field. Particular attention is given to shape the capacity of studying and interpreting data from modern scientific literature, through a series of activities going through recently published scientific papers on the subjects presented during the lectures. Of each paper, emphasis is given to the specific scientific question addressed, as compared to the status of art, then thorough analysis is made of experimental approach and methods used and data are interpreted. Finally, results are compared to the status of art and consideration of new knowledge is critically evaluated.   
The following items will be discussed:

Advanced Cell Biology (6 ECTS)

1)    Stem cells, cell differentiation and cell polarity.
2)    Apoptosis, autophagy and death signal transduction
3)    Adhesion molecules and anchorage signal transduction. Cadherins and the control of cell proliferation.
4)    Cell migration and cell-cell recognition.

Molecular Bioloby and Genomics (6 ECTS)

5)    Genomes and genome activity: microarrays and deep-sequencing applications. Different classes of coding and noncoding RNAs.
6)    Chromatin structure. Epigenetic modifications, silencing and imprinting.
7)    Alternative splicing, alternative transcription and their control. Genomic, functional and evolutionary roles.
8)    Transcriptional regulation, coactivators and corepressors and chromatin dynamics. Nuclear organization and long-range interactions.
9)    Regulatory mechanisms for transport, localization and stability of RNAs. Micro RNA and RNA binding proteins.

Dublin descriptors:

  1. Knowledge and understanding of homeostasis and cell differentiation, of the regulation of genomic activity and system biology and their experimental approaches.
  2. Applying knowledge and understanding: ability to propose and discuss appropriate and updated experimental approaches in cell and molecular biology.
  3. Making judgements: Interpretation, comparison and discussion of scientific data.
  4. Communication: Oral presentation and discussion of scientific papers, ICT.  English: reading and writing
  5. Learning skills: autonomy in the conduction of bibliografic research and understanding of scientific content.

Text Books:

Teaching material and active learning activies pubblished on Moodle platform.

GENOMES
Third Edition T. A. Brown,
University of Manchester, UK,
Garland Science
    
   
THE CELL: A MOLECULAR APPROACH
Cooper, G.M. & Hausman, R.E.
Fourth Edition
ASM Press, 2007

Exam: Oral examination with the discussion of scientific papers and valutation of the active learning activities

Propedeuticity

No formal propedeucity is required but basic knowledge in cell and molecular biology necessary

 

 


Testi consigliati e bibliografia



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Note

Image: Fluorescent DNA in Tissue Culture Cells. By injecting multiply-labeled DNA into tissue culture cells, Dr. Paddock was able to produce this beautiful image using a confocal laser scanning microscope. The various fluorescent colors each represent different target genes for the probes utilized in the experiment.

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Ultimo aggiornamento: 30/09/2010 14:48
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