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Oggetto:
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Chimica Biologica Metabolica

Oggetto:

Metabolic Biochemistry

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Anno accademico 2013/2014

Codice dell'attività didattica
MFN0324
Docente
Prof. Paola Allegra
Corso di studi
[f008-c501] LM in Biologia Cellulare e Molecolare (Classe LM-06)
Anno
1° anno
Periodo didattico
II semestre
Tipologia
Caratterizzante
Crediti/Valenza
6
SSD dell'attività didattica
BIO/10 - biochimica
Modalità di erogazione
Tradizionale
Lingua di insegnamento
Italiano
Modalità di frequenza
Lezioni facoltative e esercitazioni obbligatorie
Tipologia d'esame
Orale
Modalità d'esame
Discussione orale.
Prerequisiti
Struttura delle macromolecole biologiche;
Catalisi enzimatica;
Conoscenza delle principali vie metaboliche, delle vitamine idrosolubili e della loro trasformazione in cofattori.
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Sommario insegnamento

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Obiettivi formativi

Acquisire i principi che governano la generazione e conservazione dell’energia metabolica, il metabolismo di composti di interesse biologico, le principali alterazioni metaboliche, la produzione e l’azione tossica dei radicali liberi dell’ossigeno.

Conoscere i principali sistemi di regolazione coinvolti nel metabolismo del glucosio e del glicogeno.

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Risultati dell'apprendimento attesi

CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE
Illustrare il metabolismo nel suo insieme e nelle specifiche vie metaboliche; correlare i diversi metabolismi tra loro e conoscere i sistemi di regolazione delle principali vie metaboliche. Conoscere le leggi termodinamiche alla base dei processi metabolici. Conoscere i sistemi di produzione di energia in assenza ed in presenza di ossigeno.

CAPACITÀ DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE
Lo studente dovrà  essere in grado di comprendere altre specifiche vie cataboliche o anaboliche seguendo i principi appresi.

AUTONOMIA DI GIUDIZIO
Essere in grado di spiegare, in modo critico ed analitico, le principali leggi alla base del metabolismo e fare correlazioni tra le diverse vie metaboliche di assimilazione e produzione delle sostanze nutrienti (carboidrati, acidi grassi, proteine, acidi nucleici), nonchè sui sistemi che neutralizzano i ROS.

ABILITÀ COMUNICATIVE
Capacità di comunicare in modo coerente e corretto su diversi e specifici problemi di metabolismo, e sulla sua regolazione; sulla fosforilazione ossidativa; sui diversi sistemi che combattono le specie radicaliche dell'ossigeno.

CAPACITÀ DI APPRENDIMENTO
Capacità di apprendere autonomamente concetti di biochimica metabolica specialistica e di regolazione, mediante l'utilizzo della letteratura scientifica.

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Modalità di verifica dell'apprendimento

Esame orale con discussione scritta del metabolismo.

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Attività di supporto

Il docente è a disposizione su appuntamento per ulteriori chiarimenti.

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Programma


Principi di bioenergetica: Studio del metabolismo. l’ATP, la variazione di energia libera, il potenziale di energia di trasferimento, il NAD+, il FAD, il CoA.
Le funzioni mitocondriali. La catena di trasporto degli elettroni e la fosforilazione ossidativa. Inibitori e disaccoppianti; la termogenina.    
Meccanismi di regolazione metabolica: disponibilità del substrato, modificazioni covalenti, controllo allosterico, controllo a feed-back, controllo ormonale, ciclo futile. La carica energetica. Il rendimento energetico del metabolismo.    
Meccanismi di regolazione a cascata mono- e bi-ciclica. Meccanismi di trasduzione del segnale in epatociti, fibre - e -adrenergiche; il fosfatidilinositolo.    
Biochimica ormonale: insulina, glucagone, catecolamine, ormoni della tiroide, ormoni ipofisar, ormoni ipotalamici, la melatonina, ormoni del surrene, ormoni sessuali, ormoni prodotti da tessuti non specifici.    
Metabolismo dei carboidrati: glicolisi aerobia e anaerobia; fermentazione lattica e alcolica; shuttle del DHAP-glicerofosfato e del malato-aspartato. Rendimento energetico della glicolisi. La glicolisi in diversi tessuti: cervello, muscolo, adipocita, epatocita ed eritrocita. Regolazione della glicolisi epatica e muscolare. La carica energetica. Inibitori della glicolisi. Metabolismo del fruttosio e del galattosio. Rendimento energetico. Via dei pentosi fosfati. Metabolismo del glicogeno: struttura e funzione metabolica. Ciclo di Cori, ciclo dell’alanina. La gluconeogenesi.     
Il ciclo degli acidi tricarbossilici. Regolazione del ciclo degli acidi tricarbossilici; vie anaplerotiche. Rendimento energetico.    
Metabolismo dei lipidi. Meccanismi di controllo nel metabolismo lipidico. Demolizione dei trigliceridi nel tessuto adiposo e destino degli ac. grassi nel muscolo e nel fegato. - ossidazione degli ac. grassi, rendimento energetico; chetogenesi. Trasporto del citrato. Biosintesi degli ac. grassi. Biosintesi dei fosfolipidi di membrana. Biosintesi del colesterolo.    
Biosintesi e degradazione dei nucleotidi. Meccanismi di regolazione e sintesi di nucleotidi purinici e pirimidinici attraverso le vie ex-novo, di interconversione e di recupero. Cause di sovraproduzione di acido urico.     
Relazioni metaboliche tra organi. Ciclo digiuno-alimentazione: Metabolismi tessuto specifici.    
Degradazione degli aminoacidi e ciclo dell’urea. Reazioni di deaminazione, transdeaminazione; glutamico deidrogenasi, glutamina sintasi. Meccanismo di controllo a  “feedback sequenziale”. Aminoacidi glucogenetici e chetogenetici. Ureogenesi: regolazione e connessioni con il metabolismo dei carboidrati.
Processi di detossificazione cellulare. Glutatione. Principali funzioni; GSH perox; GSH reduttasi; tiolotranferasi; GSH solfotransferasi. Ciclo del - glutamile. Leucotrieni: Biotrasformazione e processi di detossificazione: GSH perox / GSSG reduttasi; composti di coniugazione e biosintesi degli acidi mercapturici.    
Radicali liberi.
Chimica dei radicali liberi; azione tossica dei radicali liberi sui sistemi biologici; ossigeno tripletto e ossigeno singoletto; specie radicaliche dell’O2. Fonti biologiche dei radicali liberi dell’O2. Produzione dei radicali liberi a livello mitocondriale: semiriduzione dell’ossigeno; formazione dell’anione superossido e del radicale idroperossile; formazione del radicale idrossile: reazione di Haber-Weiss e reazione di Fenton. Produzione dei radicali liberi a livello microsomiale, ruolo del cit P450. Sistemi di difesa contro il danno ossidativo.Radiolisi dell’acqua e azione scavenger del GSH. Danni causati dal radicale idrossile sui lipidi di membrana; perossidazione degli acidi grassi polinsaturi, ruolo della vit.E, del colesterolo e della vit.C; danni sugli acidi nucleici.


Generation and storage of metabolic energy. Metabolism, basic concepts and design. Strategy of metabolism. Carbohydrates. The metabolic pathways and control sites in the following metabolisms: glycolysis, citric acid cycle, oxidative phosphorylation, pentose phosphate pathway, gluconeogenesis, glycogen metabolism, fatty acid metabolism, amino acid degradation, urea cycle, biosynthesis of membrane lipids, biosynthesis of cholesterol, biosynthesis of nucleotides. Hormonal regulators of fuel metyabolism. Oxidative stress and ROS production, chemical and biological effects. Antioxidant and defense systems.
Exercises will focus on the calculations of solution concentration and on the design of enzymatic methods usefull to determine some biochemical analytes.


Testi consigliati e bibliografia

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I testi base consigliati per il corso sono:

PRINCIPI DI BIOCHIMICA - Albert L. Lehninger, 5° ed., Zanichelli Editore, 2000- Bologna.
BIOCHIMICA MEDICA –M.Lieberman and A.D.Marks, 2010 ed CEA
BIOCHIMICA – C.K. Mathews, K.E. van Holde, 2° ed. Casa Editrice Ambrosiana, 1998 – Milano.

E’ fortemente consigliato l’utilizzo del seguente materiale per approfondimenti e integrazioni:

1.    Martinez-Cayuela M. - Oxygen free radicals and human disease. Biochimie. 1995;77(3):147-61. Review.
2.    Storz G, Imlay JA. - Oxidative stress. Curr Opin Microbiol. 1999 Apr;2(2):188-94. Review.
3.    Costa V, Moradas-Ferreira P. -  Oxidative stress and signal transduction in Saccharomyces cerevisiae: insights into ageing, apoptosis and diseases. Mol Aspects Med. 2001 ; 22: 217-46. Review.



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Note

LM BA: Curriculum Ecologia Vegetale, Curriculum Conservazione e Biodiversità Animale, Curriculum Igiene dell’ambiente e del lavoro LM BCM: Curriculum Biomedico, Curriculum Biomolecolare, Curriculum NeurobiologicoCurriculum Biomedico, Curriculum Biomolecolare, Curriculum Neurobiologico

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Ultimo aggiornamento: 26/06/2014 14:14
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