- Oggetto:
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Ingegneria Proteica
- Oggetto:
Anno accademico 2014/2015
- Docente
- Prof. Gianfranco Gilardi
- Anno
- 2° anno
- Periodo didattico
- Primo periodo
- Tipologia
- A scelta dello studente
- Crediti/Valenza
- 4
- Oggetto:
Sommario insegnamento
- Oggetto:
Obiettivi formativi
Questo corso avanzato ha come scopo lo sviluppo di tematiche di ingegneria proteica e disegno di farmaci, con particolare riferimento agli aspetti interdisciplinari. Lo studente acquisira non solo i concetti fondamentali, ma anche una capacita critica nellaffrontare problemi in questo settore della ricerca, acquisendo conoscenze e dimestichezza su aspetti teorici, informatici (bioinformatica, modelling molecolare) e tecniche di laboratorio.- Oggetto:
Risultati dell'apprendimento attesi
Fornire agli studenti strumenti per il design e costruzione di proteine ed enzimi basandosi su nozioni della relazione struttura-funzione delle macromolecole biologiche.- Oggetto:
Programma
Approcci tipici dell’ingegneria proteica e del disegno dei farmaci (ciclo integrato); Richiami di strutturistica
Struttura delle proteine e folding
Bioinformatica: Banche dati per proteine: CATH, SCOP; Modelling di proteine per omologia, pattern search, calcolo di fattori energetici e elettrostatici PROCHECK, LIGPLOT, DOCK).
Disegno razionalizzato delle proteine: mutagenesi sito-specifica, metodi e approcci.
Evoluzione diretta di proteine e enzimi: mutagenesi random, ricombinazione, DNA-shuffling.
Ingegneria de novo di proteine modello per studi di folding, siti di legame per metalli, fasci di eliche.
Trasferimento elettronico nelle proteine
Ingegneria proteica applicata a studi di trasferimento elettronico intra- e inter-molecolari
Applicazioni di disegno razionalizzato per l’immobilizzazione e la costruzione di biosensori amperometrici (voltammetria ciclica, tecniche AFM e STM).
Ingegnerizzazione di anticorpi: costruzione di libraries, phage display e selezione in vitro. Applicazioni nel campo della medicina, radioimmunoterapia, attivazione pro-drug.
Basi molecolari dell’azione dei farmaci, disegno razionalizzato, sintesi combinatoriale, metodi di screening, ingegnerizzazione del P450 e principi sul metabolismo dei farmaci;
Attivita di seminari preparati e presentati dagli studenti basati su pubblicazioni dell’ultimio anno sul tema dell’ingegneria proteica e disegno di farmaci
Esercitazioni di molecular modelling con costruzione e valutazione di un modello di P450.
Testi consigliati e bibliografia
- Oggetto:
- Il materiale didattico presentato a lezione è disponibile presso questo sito.
I testi base consigliati per il corso sono: Introduction to protein structure (autori Branden and Tooze), Biosensors 2nd Edition (editors J. Cooper and A.E.G. Cass), Oxford University Press, Oxford, UK New York, US.
E fortemente consigliato lutilizzo del seguente materiale per approfondimenti e integrazioni: -lavori presi dalla letteratura come specificato durante le lezioni.
Infine sono di seguito indicati siti internet di interesse:
www.expasy.ch
www.rcsb.org/pdb - Oggetto:
Note
1° Periodo Didattico- Oggetto: