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Strutturistica di Macromolecole (non attivato nell'a.a. 2009/2010)

Codice attività didattica
S8096
Docenti
Corso di studio
[f008-c202] laurea spec. in scienze biomolecolari - a torino
Anno
1° anno
Tipologia
Caratterizzante
Crediti/Valenza
5
 
 

Obiettivi formativi

Conoscere i vari livelli di architettura delle proteine, con particolare riferimento alla loro organizzazione nella struttura tridimensionale, applicazione di programmi di visualizzazione e analisi molecolare.
Conoscenza generale della metodologia usata per determinare la struttura tridimensionale delle proteine, con particolare riferimento alla cristallografia a raggi X, NMR. Riferimenti generali di dinamica molecolare con esempi presi dalla letteratura dagli studenti stessi.
 

Risultati dell'apprendimento attesi

Fornire agli studenti conoscenze sulla relazione struttura-funzione delle macromolecole biologiche. Stimolare il senso critico nell'interpretare dati di funzioni molecolari in relazione alle strutture proteiche ed enzimatiche, anche con riferimenti a patologie.

 

Programma

Il legame peptidico e gli aminoacidi
Interazioni non covalenti che stabilizzano le proteine

Il plot di Ramachandran

La struttura secondaria (a eliche, foglietti b, b turn)
La struttura supersecondaria

La struttura terziaria e quaternaria
I domini (a, b, a/b)

Criteri per definire un dominio
Le proteine di membrana

Cristallografia a raggi X
Le banche dati SwissProt e PDB

Laboratorio di cristallografia
Metodi di previsione delle strutture

Spettroscopia NMR di molecole biologiche: teoria e applicazioni
Dinamica molecolare studiata per rilassamento NMR e spettroscopia di fluorescenza risolta nel tempo

 

Testi consigliati e bibliografia

Il materiale didattico presentato a lezione è disponibile su questo sito.
C. Branden & J. Tooze “ Introduction to protein structure” - Garland Publishing New York - ISBN: 0-8153-2305-0
A.M. Lesk “Introduction to protein architecture” - Oxford University Press = ISBN: 0-19-850474-8
A.M. Lesk “Introduction to Protein Science” - Oxford University Press = ISBN: 0-19-926511-9
Indispensabili: appunti delle lezioni
Siti internet di interesse:
www.expasy.ch
www.rcsb.org/pdb
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  • Aperta
     
    Ultimo aggiornamento: 27/07/2009 14:49
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