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Filogenesi molecolare (non pił attivato)

Codice attivitą didattica
MFN0326
Docente
Anno
1° anno, 2° anno
Tipologia
A scelta dello studente
Crediti/Valenza
4
SSD attivitą didattica
BIO/18 - genetica
Erogazione
Tradizionale
Lingua
Italiano
 
 

Programma

  • Programma
  • Programma in inglese
  • Obiettivi formativi
  • Testi consigliati
  • Modalità d'esame
  • Propedeuticità e Frequenza


Basi molecolari dell’evoluzione: struttura, funzione e meccanismi evolutivi di geni e genomi

Cambiamenti evolutivi delle sequenze amminoacidiche, sostituzioni nucleotidiche sinonime e non sinonime, orologio molecolare
Cambiamenti evolutivi delle sequenze di DNA: stima del numero di sostituzioni nucleotidiche, stima numerica delle distanze evolutive, allineamento delle sequenze nucleotidiche
Alberi filogenetici: tipi di alberi filogenetici e metodi di ricostruzione filogenetica. Metodi di distanza (UPGMA, Neighbor Joining, ecc.), metodi di parsimonia (strategia di ricerca degli alberi di MP, alberi di consenso, pesatura dei caratteri, ecc.), metodi di maximum likelihood e di inferenza bayesiana (modelli di sostituzione nucleotidica e stima dei parametri)

Accuratezza e test statistici degli alberi filogenetici: principi di ottimizzazione e errori topologici (sistematici o stocastici), bootstrap, test delle differenze topologiche, vantaggi e svantaggi dei diversi metodi di ricostruzione filogenetica.
Applicazioni e limiti della sistematica molecolare: scelta della metodologia analitica, analisi combinate

Introduzione all’uso di banche dati molecolari e di software per l’inferenza filogenetica (PAUP, MEGA, ecc), l’allineamento e l’analisi delle sequenze.

 

Note

Curriculum Ecologia Vegetale, Curriculum Conservazione e Biodiversitą Animale, Curriculum Igiene dell’ambiente e del lavoro
Registrazione
  • Aperta
     
    Ultimo aggiornamento: 15/10/2015 10:46
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